过去，Linux主要被用作服务器的操作系统，但因它的廉价、灵活性及Unix背景使得它很合适作更广泛的应用。传统上有以Linux为基础的“LAMP（Linux, Apache, MySQL, Perl/PHP/Python的组合）”经典技术组合，提供了包括操作系统、数据库、网站服务器、动态网页的一整套网站架设支持。而面向更大规模级别的领域中，如数据库中的Oracle、DB2、PostgreSQL，以及用于Apache的Tomcat JSP等都已经在Linux上有了很好的应用样本。除了已在开发者群体中广泛流行，它亦是现时提供网站务供应商最常使用的平台。
基于其低廉成本与高度可设定性，Linux常常被应用于嵌入式系统，例如机顶盒、移动电话及行动装置等。在移动电话上，Linux已经成为与Symbian OS、Windows Mobile系统并列的三大智能手机操作系统之一；而在移动装置上，则成为Windows CE与Palm OS外之另一个选择。目前流行的TiVo数位摄影机使用了经过客制化后的Linux。此外，有不少硬件式的网络防火墙及路由器，例如部份LinkSys的产品，其内部都是使用Linux来驱动、并采用了操作系统提供的防火墙及路由功能。
采用Linux的超级电脑亦愈来愈多，根据2005年11月号的TOP500超级电脑列表，现时世上最快速的两组超级电脑都是使用Linux作为其操作系统。而在表列的500套系统里，采用Linux为操作系统的，占了371组（即74.2%），其中的前十位者，有7组是使用Linux的。
2006年开始发售的SONY PlayStation 3亦使用Linux的操作系统。之前，Sony亦曾为他们的PlayStation 2推出过一套名为PS2 Linux的DIY组件。至于游戏开发商雅达利及id Software，都有为其旗下的游戏推出过Linux桌面版本。此外，Linux Game Publishing亦有专门为Linux平台撰写游戏，并致力于把其他在Windows平台编撰的游戏程序码转携至Linux平台，及为转携游戏提供使用授权。
而一个打算对所有生活在发展中国家孩子提供手提电脑的名为每孩子皆有一部手提电脑（OLPC）的项目，正是使用Linux作为缺省的操作系统。
